迟玮教授和牛龙见研究员团队在《Molecular Cell》发表重要突破成果——揭示基因调控网络的新方式！

2025年11月18日，深圳市眼科医院迟玮教授和牛龙见教授团队在国际顶尖医学期刊《Cell》子刊——《分子细胞》（Molecular Cell，影响因子16.6，中科院一区）发表最新研究成果。该研究由深圳市眼科医院作为第一作者和通讯作者单位完成。

一次实验

“同时看到基因在说什么、跟谁在对话”

团队自主开发了新型高通量技术 Hi-Coatis，可在一个实验流程中同步捕获活跃转录区域及其三维互作信号，构建出更真实、更全面的基因调控图谱。

简单来说：

传统方法像“只听到基因说话”，或“只能看到基因的空间结构”；

而Hi-Coatis像安装了一个新的“对话监控系统”，能同时看到谁在说、说了什么、跟谁互动，让基因调控研究变得更直观、更立体。

技术创新亮点

• 轻度交联保留真实转录状态，最大程度减少实验干扰；

• RNA引导的DNA链标记技术精准捕获“正在活跃的基因区域”；

• 可根据需要保留链特异性信息，进一步扩展研究深度；

• 无需抗体或探针，即可完成活跃区域富集+三维互作捕获。

最终通过高通量测序，即可绘制出高分辨率的活跃转录三维染色质图谱（图1）。

Hi-Coatis技术流程图

首次系统揭示：

被忽视的重复序列/CNV其实也“很活跃”

研究团队惊喜发现：

Hi-Coatis技术捕获到大量过去被视为“基因组噪音”的重复序列和拷贝数变异区域（CNV），它们不仅高度活跃，还与高表达基因密切相关。

功能验证进一步显示：

超过 77% 的重复序列/CNV片段

具有明确的调控活性

这意味着过去被低估的大规模基因组区域，其实在调控网络中扮演了重要角色，为阐明基因表达调控提供了全新视角（图2）。

Hi-Coatis同时捕获多种转录事件与三维染色质互作图谱

研究意义：

为疾病研究提供新的钥匙

Hi-Coatis为研究基因表达和三维染色质结构之间的关系提供了重要工具，对理解发育、分化以及包括眼科疾病在内的多种疾病机制具有广阔应用前景，为未来构建高精度调控网络奠定基础。

该研究成果的作者，分别是南方科技大学公共卫生及应急管理学院博士后李欣欣，中国科学院昆明动物研究所特别研究助理许晋升博士，南方科技大学生物系博士研究生阎晓昊，深圳市眼科医院 南方医科大学深圳眼科医学中心钟嘉泳博士为论文共同第一作者。深圳市眼科医院 南方医科大学深圳眼科医学中心迟玮教授，深圳市眼科医院 南方医科大学深圳眼科医学中心牛龙见研究员，中山大学中山眼科中心肖传乐研究员，中国科学院昆明动物研究所侯春晖研究员为本文的共同通讯作者。深圳市眼科医院为论文的第一完成单位。

迟玮教授团队

迟玮教授团队依托深圳市眼科医院 南方医科大学深圳眼科医学中心，由国家重大人才工程入选者、全球前2%顶尖科学家迟玮教授领衔，深耕眼科临床与科研一线二十余年，在眼底病、葡萄膜炎等重大致盲眼病的临床诊疗、机制研究与转化应用方面取得了一系列具有国际影响力的创新成果。

团队聚焦免疫相关眼病的关键科学问题，系统揭示了固有免疫反应失衡致病的新机制，创新性发现AIP1调控非典型炎性小体-焦亡通路等全新靶点，在《Nature Genetics》《Molecular Cell》《Advanced Science》等高水平期刊发表多篇重要论文。团队创建了不可逆致盲眼病的早期诊断新方法，将早诊准确率从20%提升至91.3%，填补了免疫眼病特异性诊断标志物的空白；开发了炎症客观影像诊断方法与定量分级标准，并建立华南眼科影像与大数据库，推动眼科AI辅助诊断系统的研发与应用。

在临床转化方面，团队创新构建了新型溶酶体降解药物，靶向抑制IL-6R、IGF1R等关键靶标（获国家发明专利4项），创建分子标志物指导下的精准治疗策略，推动相关疾病致盲率从33%大幅降至5.2%。作为核心力量参与制定首个由中国人主导的眼病国际诊断标准，打破欧美垄断，并牵头/参与国内指南及专家共识22项。

团队主持包括国家重点研发计划、国家自然科学基金重点项目在内的国家级项目6项及省部级项目12项，建设有眼-脑疾病实验室、干细胞平台等科研基地，形成“临床诊疗—机制探索—技术转化”全链条创新体系，持续推动深圳乃至全国眼科医学的高质量发展与学术引领。

通讯作者

迟玮 教授

深圳市眼科医院 南方医科大学深圳眼科医学中心院长，教授，主任医师，博士研究生导师，入选重大人才工程，2024-2025年连续入选斯坦福大学发布的全球前2%顶尖科学家榜单。广东省杰出青年医学人才、全国百篇优秀博士论文提名奖获得者等。中国医师协会眼科医师协会专委会委员、广东省医学会理事、广东省医师协会眼科分会常委、广东省医师协会眼底病学组副组长。

主持国家自然科学基金重点项目、国家重点研发计划首席科学家、国家自然科学基金区域联合重点项目、国自然面上项目等6项国家级基金、省部级基金12项。以通讯/第一作者（含共同）发表SCI论文50篇，其中16篇IF>10分，包括Nat Genetics、Mol Cell、Nat Commun、PNAS、J Allergy Clin Immunol、BMJ、Mol Neurodeger、J Am Chem Soc、Prog Retin Eye Res、Adv Sci等权威医学期刊。获得广东省科技进步一等奖（第一完成人）、中国女医师协会五洲女子科技奖。制定国际指南1项、中国指南15项，专家共识8项。

牛龙见 博士

深圳市眼科医院副研究员，理学博士，南方科技大学博士后、访问学者。长期致力于三维基因组学与基因调控研究，聚焦染色质三维结构在发育及遗传性疾病中的作用，在该领域深耕十余年。通过改进Hi-C等高通量技术，系统解析染色质动态构象的规律与机制，揭示其对基因表达的调控功能，并开发新方法研究染色质空间组织在疾病发生中的分子机制。作为项目负责人，主持国家自然科学基金、深圳市面上项目、深圳市“三名工程”项目等多项课题，并作为核心成员参与国家重点研发计划。近五年以第一作者或通讯作者在Nature Genetics、Molecular Cell、Nature Communications、Cell Reports、Nature Structural & Molecular Biology等国际高水平期刊发表多篇SCI论文，其中5篇影响因子大于10，多项研究成果入选遗传学与细胞生物学领域Top期刊，受到国际同行广泛关注。

第一作者

李欣欣 博士

毕业于华中农业大学，为南方科技大学公共卫生及应急管理学院顾东风教授团队博士后。主要研究方向为表观遗传调控及三维基因组学。参与国家自然科学基金面上项目一项。以第一作者（含共一）发表SCI论文 3篇。包括Molecular Cell、Cell Death & Disease和BMC Genomics等。

钟嘉泳 博士

毕业于暨南大学生物化学与分子生物学专业。主攻基因组与表观遗传学，专注于利用生物信息学方法挖掘单分子测序数据。研究方向包括：开发染色质互作测序技术构建三维基因组图谱；基于单细胞全长转录组研究眼组织RNA亚型表达调控；整合纳米孔多组学数据探索DNA甲基化、基因组结构与转录调控机制。在Nature Communications等期刊发表SCI论文8余篇，主持或参与多项国家及省部级基金项目，获授权专利8项，现指导多名研究生及本科生科研工作。

文/凤凰网深圳 雷可可 实习生 时芳菲

图/受访方供图